Как и в любой общественно спортивной организации ФВАР оперативное управление федерацией осуществляет Президиум Федерации, который реализует свою деятельность через профильные комитеты.

Президиум Федерации Воздушной Атлетики России — высший коллегиальный орган управления федерации ;

С момента основания создавал и возглавлял федерацию — Александр Закиров, а с 17.10.2016 возглавляет Президиум ФВАР заслуженный тренер, международный судья и в прошлом участник многочисленных Российских и международных Чемпионатов Президент Федерации Воздушной Атлетики ФВАР — Анастасия Воронцова  (Журавлева).